病毒检测，一般包括直接法和间接法：直接法，即病毒特异性抗原检测和病毒核酸检测；间接法，即血清IgM和IgG抗体检测。其中，病毒特异性抗原抗体检测平台常见的有化学发光法、酶联免疫吸附法和胶体金法，病毒核酸检测平台包括qPCR和二代测序。这些检测方法是针对病毒检测的通用平台，但各有利弊，没有一个方法可以完全替代其它方法，需要根据不同的病毒感染的路径和临床特征来决定最优的组合应用场景和顺序。此外，开发一种稳定的、高质量的新型感染性疾病的诊断试剂盒，一般最快需要3-12个月，因此疫情当下，任何一种声称准确度在90%以上的试剂盒，都是无视科学规律和客观事实，会给疫情防控的诊断网络建设带来误导。

在不同的病毒感染周期内，高滴度病毒在体内的分布也相应发生变化，导致即使同一个方法，采样方式和其分布时间点不匹配，也会带来诊断偏差。比如在新冠病毒感染初期，病毒在下呼吸道大量繁殖，因此痰液样本滴度最高，随后在上呼吸道中鼻咽拭子样本中被检测到，提示此时病毒具有提示较强的传播力，而在治疗康复过程中又会出现肛拭子比鼻咽拭子检测率高的情况；

在不同的病毒感染周期内，所检测的各种指标，包括抗原、核酸、抗体等，其出现和峰值分布的时间并不一致，因此也没有一个指标会横跨整个病原感染周期，一直处于高峰状态。因此采样周期和检测方法的组合如果不匹配，则会带来诊断偏差。比如核酸检测，一般在病毒感染初期较高，灵敏度高；而IgM抗体检测在感染早中期开始出现，灵敏度尚可，但滞后于核酸检测的灵敏度窗口期；而IgG抗体则在感染中后期才出现，检测灵敏度高，但特异性相对前二种方法较差，一般用于辅助判断出院。而《柳叶刀》子刊3月23日刊发的一篇论文显示，新冠患者在发病初期病毒载量即出现峰值，这意味着许多新冠患者在处于轻症状态时，可能已无形中成为了巨大的移动“病毒源”。因此新冠病毒在早期窗口期的检测非常重要。